香港在政治、社會及經濟方面經歷了不少轉變，很大程度影響了本港市民的生活以及香港的社會福利發展。一九八九年六四事件及面臨九七主權回歸的不明朗因素，加速港人移居外地的情況，亦造成不少家庭因此而分隔兩地。與此同時，香港經濟結構急劇轉型，大量工廠北移，不少港人要到內地工作，造成家庭成員聚少離多。此外，低學歷及低技術的一群亦面對失業及開工不足的情況，貧窮問題開始浮現。
面對種種社會變遷，社會福利服務機構不斷反思及創新，並配合國際社會的大氣候，為各種服務對象，以及對社會服務較少認識而又極需協助的弱勢社群，包括新來港定居人士、領取綜援人士、失業及就業不足人士、貧窮人士等，在政策倡導、服務協調、人力訓練、公眾教育等方面，作出相應措施及回應，提供最適切的服務。此外，亦舉辦「國際復康日」、「長者日」、「國際家庭日」等社區教育活動，動員地區關懷弱勢社群。社聯開展多項社會政策研究、訂立及公布社會發展指標，並參與多項社會政策的制訂。於此期間長者、復康、家庭服務均有重要的發展。社聯又協助成立香港社會福利專業人員註冊局和多個自助組織，並增強與內地社會福利界的交流，推動兩地的社會福利發展。
| 1990 |
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- 與中國社會工作者協會合辦「內地與香港社會福利發展研討會」，首屆在北京舉行。
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1991 |
- 政府邀請社福界參與擬定「跨越九十年代香港社會福利」白皮書。
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- 聯合國制訂「反濫用藥物十年」方針，政府與志願機構舉辦活動響應。
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1992 |
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1993 |
- 政府確立每年11月第3個星期日（即「老人節」）為「長者日」。
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- 聯合國將每年12月3日訂為「國際復康日」及將1993-2002年訂為「亞太區殘疾人士十年」。
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- 社聯連同運輸署推出「傷殘的士乘客在限制區上落車證明書」。
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- 連同各區區議會舉辦大型活動首次慶祝「國際復康日」。
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- 第二次「內地與香港社會福利發展研討會」在上海舉行，主題為「政府與社會團體在社會福利發展中的角色」。
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1994 |
- 政府發表「老人服務工作小組」報告書及「青少年中心服務檢討工作小組」報告書，開始發展「青少年綜合服務中心」。
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- 社聯與社署聯合舉辦活動，響應1994「國際家庭年」。
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1995 |
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- 社聯首次就施政報告向政府提交建議書，主題為「非政府機構服務交代新紀元」。
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- 第三次「內地與香港社會福利發展研討會」在香港舉行，主題為「整合和參與 - 社會福利服務的規劃與實施」。
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1996 |
- 政府實施「殘疾歧視條例」和「性別歧視條例」，並成立「平等機會委員會」。
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- 政府舉行「毒品問題高峰會」，並建議設立「禁毒基金」。
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- 社聯響應聯合國將1996年訂為「國際消除貧窮年」，並舉辦「貧窮與社會發展」高峰會。
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1997 |
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- 立法局通過「新修訂幼兒中心條例」，禁止不合適的人士擔任幼兒托管人。
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- 獲愛滋病信託基金贊助，推展「愛滋病支援服務計劃」。
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- 慶祝金禧紀念，大型慶祝活動包括「愛心服務之旅」、「邁向廿一世紀社會福利發展」本地會議、「社會福利傑出貢獻獎」選舉，以及「社聯金禧紀念大匯演」。
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- 第四次「內地與香港社會福利發展研討會」在武漢舉行，主題為「社區服務及社區發展 - 以社區為基礎的福利服務的規劃和實施」。
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1998 |
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- 社聯主辦第十一屆「國際復康總會亞太區會議暨亞太殘疾人士十年九八推廣大會」，同期舉行首次香港國際復康展覽。
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- 由賽馬會慈善基金贊助，社聯推展「結伴同行」新來港人士社區教育計劃。
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- 成立「處理失業策略問題」委員會，並向政府提交「就業支援綜合計劃」建議書。
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- 與廣東省婦女聯合會合辦「婚姻•家庭•兒童：粵港跨向二十一世紀社團工作研討會」。
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1999 |
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- 聯合國將1999年訂為「國際長者年」，社聯與社署合辦「國際長者年亞太區研討會」。
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- 積極參與各項服務檢討，包括青少年服務、家庭服務、幼兒日間服務、家居照顧以外判服務形式運作等。
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- 與中國藥物濫用防治協會合辦首屆「中國內地與香港藥物濫用防治研討會」。
- 與41個社會服務單位攜手推展「地區網絡就業支援計劃」。
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